Raportul Tismaneanu va primi in curind o replica din partea comisiei de istorici alesi de Biserica Ortodoxa Romana pentru a studia comunismul.

Biserica incearca sa pastreze o imagine curataa fostului Patriarh Teoctist Nu exista documente pentru a demonstra ca PF Teoctist Arapasu a fost homosexual, ca PF Iustin Moisescu a fost un informator sau ca mitropolitul Antonie Plamadeala al Ardealului ar fi fost ofiter sub acoperire al Securitatii. Acestea sint citeva dintre ideile sustinute de raportul propriu al Bisericii privind perioada comunista, raport care a fost finalizat deja de istorici, insa urmeaza sa fie discutat, validat de Sfintul Sinod si apoi publicat. Istoricul George Enache, unul dintre autori, il numeste „o recenzie a Raportului Tismaneanu", sustinind ca arata greselile metodologice savirsite de membrii comisiei prezidentiale atunci cind au scris despre Biserica. „Raportul a tratat problema simplist si ideologic. Au fost alese doua, trei chestiuni si s-a scris pe marginea lor. Or, in 20 de pagini, ar fi trebuit sa se faca o sinteza, sa se ofere o viziune", considera George Enache. Istoricii alesi de BOR incearca sa demonstreze ca relatia BOR cu regimul comunist a fost una complexa si ca, in esenta, ierarhii nu au facut decit sa apere Biserica in fata presiunilor. O forma initiala a acestei „recenzii" a fost finalizata in vara lui 2007, insa dezvaluirile privind relatiile unor ierarhi cu Securitatea, ce au urmat mortii PF Teoctist, i-au facut pe autori sa schimbe accentul. „Am acordat o mare atentie anilor ’80, in care presiunile asupra Bisericii au fost mai mari chiar decit in anii ’50. Dupa Perestroika, Biserica s-a aflat, practic, in stare de asediu", sustine George Enache.

Astfel, raportul BOR incearca sa demonteze si unele informatii publicate in presa in ultimul an. Istoricul George Enache sustine, de exemplu, ca documentul emis de Departamentul Cultelor in 1988 si care face referire la faptul ca PF Teoctist ar fi fost homosexual nu are nici o validitate intrucit el colporteaza o informatie data in 1949 sub presiune, in arest, de un fost diacon de la Catedrala Patriarhala. „In plus, documentul din 1988 nu face parte dintr-un dosar de cadre, ci, dimpotriva, a fost intocmit in cadrul unei operatiuni de urmarire a lui". „Pentru ca PF Teoctist a mers in strainatate, ca si rabinul Moses Rosen, Directia Politica din cadrul CC a cerut informatii de la Departamentul Cultelor. Iar birocratia era mare: chiar daca o informatie nu se dovedise, era reluata in toate rapoartele", spune istoricul. Nici colaborarea predecesorului, PF Iustin Moisescu, nu este creditata de comisia BOR. „E posibil ca el sa fi fost folosit, inainte de 1939, ca si George Enescu, Maria Tanase si Elena Vacarescu, de SSI, in strainatate. El nu a dat insa cu subsemnatul la Securitate. La nivelul sau, cel care il putea contacta trebuia sa aiba cel putin gradul de colonel, iar in rapoarte acesta putea folosi un nume conspirativ pentru a nu afla oricine cu cine a stat de vorba", sustine istoricul George Enache, insistind pe ideea „negocierii" ierarhilor ortodocsi cu regimul cu scopul imblinzirii unor masuri impotriva Bisericii. Un exemplu ar fi „trocul" realizat in privinta Manastirii Vacaresti: aceasta a fost darimata pentru a salva de la aceeasi soarta ansamblul patriarhal, spun istoricii BOR.