De la descoperirea primului schelet de
Archaeopterix in Bavaria in anul 1861, cei mai multi specialisti in evolutie au considerat acest dinozaur cu pene ca fiind cel mai vechi tip de pasare. In "arborele filogenetic", care stabileste liniile de rudenie dintre specii,
Archaeopterix a ocupat in mod logic locul de baza in ramura "Aviarelor" din care se trag pasarile moderne.De-a lungul timpului, cativa cercetatori au avut o serie de dubii atunci cand acele caracteristici considerate ca fiind atribute tipice "aviare" la Archaeopterix (pene, carena, picioare cu trei degete etc.) au fost descoperite si la alti dinozauri, iar acestia erau terestri. Insa, in absenta unor dovezi formale, "bunicul" Archaeopterix continua imperturbabil sa domneasca asupra regnului aviar.