Embrionii pot fi criogenizati in orice stadiu dinaintea implantarii, din prima zi (stadiul de celula) pana in ziua 5-6 (stadiul de blastocist). Totusi, pentru a putea selecta embrionii cu cel mai mare potential de viabilitate si calitate si pentru a evita inghetarea unui numar foarte mare de embrioni, se prefera criogenizarea celor ajunsi in stadiul de blastocist.

In unele cazuri, transferul embrionilor proaspeti nu se poate realiza din anumite motive: femeia poate fi supusa la risc datorita hieprstimularii ovariene ce ar fi complicate de sarcina, sau urmeaza anumite tratamente, de exemplu chimioterapia. In aceste cazuri, toti embrionii obtinuti vor fi inghetati.