Agentia Nationala de Administrare Fiscala a constatat mai multe deficiente in activitatea Loteriei Romane, precum scaderea cotei de piata si plati salariale necuvenite, in urma unui control care a vizat perioada 2003-2006, si a inaintat raportul de control catre DNA.
In urma controlului, ANAF a constatat ca in cazul Loteriei a scazut cota de piata s-a redus dupa 2004 din cauza restrangerii retelei de vanzare si mandatare care reprezinta, in prezent, numai 64% din numarul existent in 2003. Reducerea cotei de piata a determinat, implicit, o scadere a veniturilor si a profitului companiei. De asemenea, controlul a scos la iveala ca bugetele de venituri si cheltuieli, precum si indicatorii de performanta au fost fundamentate eronat, in perioada 2003-2005. Din acest motiv, veniturile totale realizate au fost cu mult mai mari decat cele previzionate (195% in 2003, 280% in 2004, 175% in 2005), iar profitul brut anual a fost cu mult mai mare decat cel previzionat (317% in 200, 453% in 2004 si 190% in 2005 . Prin urmare, directorul general a luat 11,79 miliarde lei vechi, in perioada 2003-2005, din care 7,59 miliarde lei vechi au fost sporuri, indemnizatii, prime si stimulente, iar 4,20 miliarde lei vechi au reprezentat cota la fondul de participare a salariatilor la profitul companiei. De asemenea, membrii Adunarii Generale a Actionarilor au incasat 1,25 miliarde lei vechi, membrii Consiliului de Administratie au primit un miliard lei vechi, iar cenzorii 100 milioane lei vechi. Loteria a promovat produse loteristice, cum ar fi Videoloterie si Pariloto, pentru care nu are monopol. Aceste produse au generat pierderi financiare, in perioada 2003-2006, de circa 2.200 miliarde lei vechi. Pierderile au fost cauzate de clauzele din contractele incheiate cu diversi parteneri, prin care acestia primesc 80% din incasari si de mentinerea preturilor fixe, de la lansare pana in prezent. Alte nereguli constatate de controlul ANAF vizeaza retragerea de pe piata a 17,9 milioane de lozuri, pe 30 iunie 2006, pentru ca nu aveau inscris pretul in lei noi, asa cum prevedea legea. Retragerea lozurilor a pagubit compania cu circa 6,46 miliarde lei vechi. ANAF a gasit nereguli si dupa 1 iulie 2006, in modul de comercializare a lozurilor intrucat valoarea serviciilor prestate de unii agenti economici parteneri nu au fost determinate la incheierea contractelor. Din acest motiv bugetul de stat a fost pagubit cu circa 430 miliarde lei vechi, reprezentand TVA datorata de catre prestatorul servicilor. Conducerea Loteriei Romane a fost inlocuita in martie 2006. Fostul director general si presedinte al Loteriei, Nicolae Cristea, a fost schimbat din functie, iar in locul sau a fost numita Liliana Ghervasuc. In aceeasi perioada, ministrul finantelor a facut modificari si in Consiliul de Administratie al Loteriei, ca urmare a unor articole de presa care semnalau mai multe nereguli in activitatea companie.